功能性消化不良是一種有關消化功能障礙的癥候群，無十分明確的定義，對于它的診斷標準國內較公認的有以下幾條。
1、具有典型的上腹飽脹、疼痛不適、食欲下降、惡心、嘔吐、反酸、噯氣等上消化道癥狀。持續或間斷發作，時間超過4周。
2、經詳細問診、查體、鋇餐胃腸造影、消化內鏡、消化系B超檢查及各項實驗室檢查等，未發現有器質性病變存在，此外，也要注意內分泌疾病，尤其是糖尿病和甲狀腺機能低下，因為這些代謝性疾病常常伴有胃腸功能障礙的臨床表現。
3、消化道運動功能檢查，提示有食管、胃運動功能障礙存在。
對于初步診斷為功能性消化不良的病人還應隨診觀察，因有報告有些最初診斷為本病的患者在隨診過程中出現別的病癥，換言之，這些患者的最初的診斷是不對的。
